CDK

出典: Cheminformatics

Chemistry Development Kit (http://almost.cubic.uni-koeln.de/cdk/cdk_top) は化合物情報をJavaから扱うためのライブラリです．RCDKをインストールする事でChemRubyからCDKの機能を使うことができます．

1. 最大共通部分構造の計算
2. Molecular Descriptorsの計算．

参考

• API http://cheminfo.informatics.indiana.edu/~rguha/code/java/nightly/api/

Bibilography

1. Steinbeck C, Han Y, Kuhn S, Horlacher O, Luttmann E, Willighagen E.L., J Chem Inf Comput Sci. 2003 Mar-Apr;43(2):493-500 PubMed: 12653513
2. Steinbeck C, Hoppe C, Kuhn S, Floris M, Guha R, Willighagen EL., Curr Pharm Des. 2006;12(17):2111-2120 PubMed: 16796559